Pegmatite entstehen bei der langsamen Abkühlung (mehrere hunderttausend Jahre) großer Tiefengesteinskörper, wenn sich die Hauptmasse des Gesteins bei fortschreitender Mineralisation bereits gebildet hat.

Aus den gasreichen Restschmelzen entstehen in der sogenannten pegmatitischen Phase besonders grobkristalline Minerale.